Theo đó, Hội đồng xét xử (HĐXX) đã tuyên phạt bị cáo Trần Kỳ Hình 17 năm tù về tội nhận hối lộ; 5 năm tù về tội lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ; tổng hợp hình phạt là 22 năm tù (giảm 3 năm). Bị cáo Đặng Việt Hà bị tuyên phạt 17 năm tù (giảm 2 năm) về tội nhận hối lộ.
Đối với các bị cáo còn lại, HĐXX chấp nhận kháng cáo xin giảm nhẹ hình phạt cho 125/144 bị cáo, 12 bị cáo bị HĐXX bác kháng cáo.
Theo HĐXX, có đủ cơ sở để kết luận tòa án cấp sơ thẩm xét xử các bị cáo về tội danh và khung hình phạt là phù hợp, đúng với quy định của pháp luật. Sau khi xét xử sơ thẩm, các bị cáo không kháng cáo về tội danh, Viện kiểm sát không kháng nghị nên HĐXX không xem xét xét về phần tội danh.
Về số tiền hưởng lợi, cơ quan tố tụng cấp sơ thẩm đã quy kết các bị cáo trong vụ án này nhận hối lộ của các Trung tâm đăng kiểm theo quy ước chung, theo quy luật chung. Việc nhận hối lộ được thực hiện trong thời gian dài, dữ liệu vi phạm của các phương tiện đã được các bị cáo điều chỉnh.
Vì vậy, cấp sơ thẩm xác định số tiền nhận hối lộ các bị cáo phải chịu trách nhiệm và số tiền hưởng lợi dựa trên theo quy ước chung, dựa trên lượt phương tiện kiểm định, thời gian làm việc của các bị cáo là phù hợp.
Do đó, ý kiến của các bị cáo đề nghị HĐXX xem xét lại số tiền thu lợi bất chính là không có cơ sở để chấp nhận. Tuy nhiên, có một số bị cáo trong quá trình điều tra, truy tố và xét xử có sai sót số tiền hưởng lợi song việc xác định lại số tiền thu lợi không làm thay đổi khung hình phạt của các bị cáo. Vì vậy, HĐXX xem xét điều chỉnh và cân nhắc khi xem xét hình phạt đối với các bị cáo này.
Đối với kháng nghị của Viện kiểm sát nhân dân TP.HCM và kháng cáo xin giảm nhẹ của các bị cáo, HĐXX nhận thấy, đa phần các bị cáo đều bị áp dụng tình tiết tăng nặng là phạm tội 2 lần trở lên, đồng thời có nhiều tình tiết giảm nhẹ.
Tuy nhiên, vẫn có một số bị cáo thực hiện hành vi phạm tội với tính chất, mức độ thấp hơn nhưng bị tòa án cấp sơ thẩm xét xử với mức hình phạt cao hơn các bị cáo khác trong cùng vụ án là chưa phù hợp, chưa bảo đảm tính công bằng và phân hóa tội phạm, đặc biệt đối với các bị cáo là cấp dưới có vai trò phụ thuộc.
Ngoài ra, trong quá trình xét xử phúc thẩm, một số bị cáo bổ sung thêm nhiều tình tiết mới so với giai đoạn xét xử sơ thẩm nên HĐXX đánh giá tính chất, mức độ hành vi phạm tội của từng bị cáo, hậu quả, hành vi phạm tội gây ra, có cơ sở chấp nhận giảm nhẹ hình phạt cho một số bị cáo.
Đối với bị cáo Trần Kỳ Hình, HĐXX xác định, bị cá đã nhận hối lộ hơn 7 tỷ đồng của nhiều doanh nghiệp, các đơn vị đăng kiểm, bỏ qua sai phạm trong việc cấp phép đủ điều kiện hoạt động trung tâm đăng kiểm, sai phạm trong quá trình kiểm định phương tiện.
Ngoài ra, bị cáo Hình còn lợi dụng chức vụ, quyền hạn vị trí công tác làm trái quy định, duyệt cấp đủ năng lực cho 63 cơ sở không đủ điều kiện, tạo điều kiện cho cơ sở đóng tàu hoạt động trái pháp luật, làm ảnh hưởng đến hoạt động bình thường của các Chi cục đăng kiểm và Cục Đăng kiểm Việt Nam.
Tuy nhiên, bị cáo có nhiều tình tiết giảm nhẹ, trong đó có có tình tiết bị cáo đã tích khắc phục hậu quả, nộp lại số tiền hưởng lợi… Do vậy, HĐXX cho rằng có căn cứ để xem xét giảm nhẹ cho bị cáo một phần hình phạt.
Đối với bị cáo Đặng Việt Hà, tòa xác định bị cáo Hà phải chịu trách nhiệm hình sự về tổng số tiền nhận hối lộ là hơn 40 tỷ đồng, bị cáo hưởng lợi tổng cộng gần 8,4 tỷ đồng.
Tại tòa phúc thẩm, bị cáo Hà đã nộp thêm 5 tỷ đồng tiền hưởng lợi, đồng thời bị cáo cũng có nhiều tình tiết giảm nhẹ nên HĐXX ghi nhận làm căn cứ giảm mức án từ 19 năm xuống còn 17 năm tù cho bị cáo Đặng Việt Hà.